互动社区 · 2025年7月13日 0

基因表达是如何被调控的?

 

基因表达是一个受控的过程。调控使得生物体能够以高效节能的方式,迅速并有效地应对细胞内外的环境刺激。当细胞接收到生产特定分子产物的信号时,某个基因才会被“开启”或表达。

受调控的基因表达使细胞能够在恰当的时间生产身体所需的产物。调控作用贯穿于基因表达的各个阶段:转录、转录产物加工以及翻译。

转录是基因表达的第一步,就像在生成蛋白质之前先写一份“生产说明书”。这个说明书就是mRNA,它是由一种叫RNA聚合酶的酶来“抄写”DNA内容而来的。

在基因表达的所有环节中,转录阶段是最常被调控的,因为一旦转录开始,后面的步骤也很容易顺着进行下去,所以在这一步进行“把关”最有效。

对于一个单独的基因来说,只有一条DNA链是编码链,但基因分布在DNA的两条链上。DNA的密码总是以编码链的5'到3'方向读取,然而,RNA的信息是从模板链以3'到5'方向进行转录的。这样转录出的mRNA就与编码链几乎一致(除了T变成U),等于是复制了编码链的信息。
对于一个单独的基因来说,只有一条DNA链是编码链,但基因分布在DNA的两条链上。DNA的密码总是以编码链的5’到3’方向读取,然而,RNA的信息是从模板链以3’到5’方向进行转录的。这样转录出的mRNA就与编码链几乎一致(除了T变成U),等于是复制了编码链的信息。

真核生物的mRNA转录主要由RNA聚合酶II完成,这是一种专门识别和抄写蛋白质编码基因的酶。

转录过程分为三个主要阶段:

  1. 起始(initiation):RNA聚合酶找到正确的起点,开始解开DNA;
  2. 延伸(elongation):RNA聚合酶沿着DNA模板向前移动,合成出mRNA链;
  3. 终止(termination):RNA聚合酶完成抄写并释放mRNA,结束转录。

在这些阶段中,“起始”阶段的调控最关键,它决定了一个基因是否会被开启、开启得多频繁。

当细胞需要某种蛋白质时,转录过程就会启动。在转录开始前,会先形成一个由多种调控分子组成的复合体,这被称为转录起始复合物(TIC)。

最早参与TIC形成的是转录因子,它们是调控基因表达的关键蛋白质。人体细胞中含有数千种转录因子。转录因子能够识别并结合到特定的DNA序列或“基序(motif)”上。

转录因子结合的位置是基因上的启动子区域(promoter),这个区域包含一个特定的核苷酸序列,叫做TATA盒(TATA box),它位于转录起始位点的上游。当转录因子就位后,RNA聚合酶会找到并结合到启动子上,牢牢地夹住DNA。

转录起始复合物
转录起始复合物

接着,DNA上另一个可能距离TIC较远的区域——增强子(enhancer),也会通过DNA弯曲的方式靠近TIC上方。调控蛋白质会帮助这个结构的形成和定位。

最后,一个由多种蛋白质组成的大型复合物——介导子复合体(mediator),会结合到增强子上的激活蛋白(activator proteins)上,像桥梁一样连接起RNA聚合酶、转录因子和增强子序列。

只有当所有这些调控基因和分子都处于活跃状态并到达正确位置时,转录才能真正开始。

当转录进入延伸阶段时,构成转录起始复合物的调控分子会被释放,RNA聚合酶从启动子区域开始沿DNA移动。

转录延伸是通过反复添加互补的核苷酸来合成一条mRNA链的过程。

核苷酸的添加由转录延伸因子控制,这些蛋白质可以稳定RNA聚合酶与DNA之间的结合,并调节转录速度。
RNA聚合酶平均的延伸速度大约是每秒60个碱基。

新生成的RNA链会暴露在细胞酶的攻击下。为防止被降解,其5’端会加上一个甲基化帽子,起到保护作用。

斑马鱼Foggy蛋白通过与非磷酸化RNA聚合酶相互作用,阻止其催化转录延伸而发挥作用。当该聚合酶的C末端结构域被磷酸化时,Foggy不再抑制其活性,转录延伸得以继续进行
斑马鱼Foggy蛋白通过与非磷酸化RNA聚合酶相互作用,阻止其催化转录延伸而发挥作用。当该聚合酶的C末端结构域被磷酸化时,Foggy不再抑制其活性,转录延伸得以继续进行

延伸过程会持续,直到调控蛋白识别到特定的终止序列。此时,转录终止,RNA聚合酶和新生成的mRNA会从DNA模板上分离出来。

与转录过程的其他阶段一样,终止过程也很复杂,涉及多个分子参与。

新转录完成的mRNA在3’末端也需要保护。通常会加上一串腺嘌呤(A)碱基,这个过程叫做加多腺苷化(polyadenylation)。这个poly-A尾巴可以增强mRNA的稳定性,防止其被降解。

在mRNA进入细胞质之前,它还需要进一步的加工处理。剪接的过程会将内含子去除,剩下的外显子被连接在一起,形成一条完整的mRNA分子。
剪接是由一种称为剪接体的RNA和蛋白质复合体执行的,这一过程受到特定序列识别机制的调控。剪接机制能够识别mRNA上应当切割的位置,并将剩余外显子的两端重新连接在一起。

加工完成的mRNA随后离开细胞核,进入细胞质,参与下一阶段的蛋白质合成:翻译。

可变剪接:从同一个基因中,可以通过将不同组合的外显子拼接在一起来生成多种不同的蛋白质产物。
可变剪接:从同一个基因中,可以通过将不同组合的外显子拼接在一起来生成多种不同的蛋白质产物。

在翻译过程中,mRNA的核苷酸序列会被转译成蛋白质的氨基酸序列。翻译需要复杂的分子机器,包括核糖体、转运RNA,以及许多辅助的调控分子。

与转录类似,翻译也包括三个受控阶段:起始、延伸和终止。

翻译起始阶段是将一个核糖体复合体组装到mRNA的起始位点上,这个位点由起始密码子AUG指定。

一个核糖体包含小亚基和大亚基。

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起始因子和酶会调节翻译起始过程,这些调控分子共同形成一个起始复合物,其中包括蛋白质、核糖体、mRNA和tRNA。

延伸过程是将氨基酸按照mRNA指定的顺序逐一添加到不断增长的多肽链上。

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这一过程由称为延伸因子(elongation factors)的蛋白质控制,它们帮助将对应的tRNA送入核糖体。

当核糖体遇到终止密码子时,翻译结束,终止密码子决定蛋白质的长度。
这一过程涉及名为释放因子(release factors)的蛋白质。终止时,多肽链被释放,核糖体也从mRNA上解离。

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